menseki https://blog.hatena.ne.jp/menseki/ ・・・ https://menseki.hatenablog.jp/ Rust Rustが注目を集めているらしいので流行りにのって使ってみました。 RustにはRust-Bioというバイオインフォマティクス用パッケージが存在します。そこで、今回はこれを用いてGzip圧縮されたFASTAファイルを読み込むプログラムを書いてみます。 まずはコードの全体から。 use structopt::StructOpt; use std::fs::File; use bio::io::fasta::{self, FastaRead}; use flate2::bufread::MultiGzDecoder; use std::io::BufReader; use std::ffi::Os… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmenseki.hatenablog.jp%2Fentry%2F2021%2F09%2F08%2F000000" title="Rust-BioでGzip圧縮されたFASTAを読み込む - ・・・" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-09-08 00:00:00 rich https://menseki.hatenablog.jp/entry/2021/09/08/000000 1.0 100%