menseki https://blog.hatena.ne.jp/menseki/ ・・・ https://menseki.hatenablog.jp/ bcftools 1. Contig情報の付加 VCFファイルを扱っているときに以下のようなwarningが出ることがあります。 [W::vcf_parse] Contig 'chr1' is not defined in the header. (Quick workaround: index the file with tabix.) これはVCFファイルのヘッダーに以下のようなContig情報がない場合に出ます。 ##contig=<ID=chr1,length=123456789> メッセージにあるように、 tabix、または bcftools index でインデックスを作成すれば解決します。 ind… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmenseki.hatenablog.jp%2Fentry%2F2025%2F05%2F19%2F080000" title="bcftools機能メモ-01 - ・・・" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2025-05-19 08:00:00 rich https://menseki.hatenablog.jp/entry/2025/05/19/080000 1.0 100%