MikuHatsune https://blog.hatena.ne.jp/MikuHatsune/ 驚異のアニヲタ社会復帰の予備 https://mikuhatsune.hatenadiary.com/ R 遺伝医学 毒性 Rpackage Rを使いこなす SKATという手法があるらしい。 kernel methodというなんとも中二病的ネーミングの手法を用いて、レアバリアントがどうたらこうたら言っていたがちょっと追いつけなかった。 SKATをやってみる。 昔やったロジスティック回帰をやると library(SKAT) data(SKAT.example) attach(SKAT.example) g0 <- glm(y.b ~ y.c, data=SKAT.example, family="binomial") p <- function(x){ 1/(1+exp(-sum(g0$coefficients * c(1, x)))) } s0 <… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmikuhatsune.hatenadiary.com%2Fentry%2F20130617%2F1371464399" title="SNP-set (Sequence) Kernel Association Test (SKAT) - 驚異のアニヲタ社会復帰の予備" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.d.st-hatena.com/diary/MikuHatsune/2013-06-17.png Hatena Blog https://hatena.blog 2013-06-17 19:19:59 rich https://mikuhatsune.hatenadiary.com/entry/20130617/1371464399 1.0 100%