MikuHatsune https://blog.hatena.ne.jp/MikuHatsune/ 驚異のアニヲタ社会復帰の予備 https://mikuhatsune.hatenadiary.com/ R Rpackage Rを使いこなす 医学 SPADEという細胞分化の分岐図を描く手法を教えてもらったのでやってみる。 FCMから得られたデータを使う。 デフォルトだと出力が pdf にしかならなくてイラッ☆としたのでノードのサイズを取得して igraph でゴリ押しした。 library(spade) library(flowViz) data_file_path = system.file(file.path("extdata","SimulatedRawData.fcs"), package = "spade") output_dir <- tempdir() transforms <- c(`marker1`=flowCore:… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmikuhatsune.hatenadiary.com%2Fentry%2F20130922%2F1379755745" title="Cyto Spanning tree Progression of Density normalized Events (SPADE) - 驚異のアニヲタ社会復帰の予備" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.d.st-hatena.com/diary/MikuHatsune/2013-09-22.png Hatena Blog https://hatena.blog 2013-09-22 18:29:05 rich https://mikuhatsune.hatenadiary.com/entry/20130922/1379755745 1.0 100%