MikuHatsune https://blog.hatena.ne.jp/MikuHatsune/ 驚異のアニヲタ社会復帰の予備 https://mikuhatsune.hatenadiary.com/ R 形・動き Rpackage 数理モデル Rを使いこなす 数学 医学 読んだ。BMC Cell Biology201011:24 細胞の移動追跡を自動化してやってくれるソフトウェアTime Lapse Analyserの話。 マニュアルでやると細胞全体はもちろんチェックできないし、代表的な20細胞を選んでtracking してもらったら軒並みAMD (average mean distance, 細胞集団全体でどれくらい移動距離があるか)が過大評価傾向にあると。 細胞の動いた筋道の推定には、各写真での細胞位置をnearest neighbor でつなげて、ジグザグな動きをKalman filterで平滑化しながら、いい感じの線を推定する。 論文のFigure 3… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmikuhatsune.hatenadiary.com%2Fentry%2F20160501%2F1462086813" title="Kalman filter を用いてparticle tracking - 驚異のアニヲタ社会復帰の予備" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.d.st-hatena.com/diary/MikuHatsune/2016-05-01.png Hatena Blog https://hatena.blog 2016-05-01 16:13:33 rich https://mikuhatsune.hatenadiary.com/entry/20160501/1462086813 1.0 100%