MikuHatsune https://blog.hatena.ne.jp/MikuHatsune/ 驚異のアニヲタ社会復帰の予備 https://mikuhatsune.hatenadiary.com/ R Rpackage 統計 Rを使いこなす 医学 読んだ Nat Genet. 2016 Aug 1. 様々なデータを取ってきて、遺伝子との相関があるかを解析するわけだが、サンプルの人数、組織、遺伝子の3次元をサンプル×要素(component やfactor と呼ぶ)と要素×遺伝子の行列に分解することで、テンソル分解してデータの構造をいじる。 もちろん、時間次元をいれて4次元テンソルとかN次元テンソルとかも発展版ができる。 遺伝子を扱うときは、たいてい、遺伝子発現データが数万で、サンプルが100から1000といういわゆるp>>n 問題に直面する。そのため、spike-and-slabという方法で変数を減らしている。 個の変数がモデルにあると… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmikuhatsune.hatenadiary.com%2Fentry%2F20160803%2F1470190647" title="Spike-and-slab - 驚異のアニヲタ社会復帰の予備" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.d.st-hatena.com/diary/MikuHatsune/2016-08-03.png Hatena Blog https://hatena.blog 2016-08-03 11:17:27 rich https://mikuhatsune.hatenadiary.com/entry/20160803/1470190647 1.0 100%