MikuHatsune https://blog.hatena.ne.jp/MikuHatsune/ 驚異のアニヲタ社会復帰の予備 https://mikuhatsune.hatenadiary.com/ R Rpackage Rを使いこなす cpp 形・動き Python 数学 医学 蛍光イメージング動画があって、そこから細胞の3次元の形を再構成したい。 手順としては、 蛍光イメージの取得：他力本願 2Dでのセグメンテーション：他力本願、大津法 セグメンテーションされた領域の抽出：openCV セグメンテーションされた領域内で欠けている部分を埋める：openCV z方向の何枚かを並べて3次元構成する：マーチングキューブ という感じでやる。 蛍光染色した細胞はこんな感じで観察できる。 すべてのz方向では14枚の画像がある。大津法でのセグメンテーション結果は以下の通りである。 zz-007.png という連番で保存されているとする。 あるディレクトリに連番で画像が入っているもの… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fmikuhatsune.hatenadiary.com%2Fentry%2F20170318%2F1489842152" title="ボクセルデータから形を構成する - 驚異のアニヲタ社会復帰の予備" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.d.st-hatena.com/diary/MikuHatsune/2017-03-18.png Hatena Blog https://hatena.blog 2017-03-18 22:02:32 rich https://mikuhatsune.hatenadiary.com/entry/20170318/1489842152 1.0 100%