oosakik https://blog.hatena.ne.jp/oosakik/ ウミガメバイオインフォ https://oosakik.hatenablog.com/ VMD 概要 vmdで水素結合の解析をする。GUIとCUIでの方法を紹介する。 環境 macOS Mojave 10.14.5 vmd 1.9.3 GUIでの方法 まずは構造ファイルとトラジェクトリ ファイルを読み込む。読み込み方はこちら → VMDの使い方の基本 (Mac) 水素結合の数をプロット VMD Main ==> Extensions ==> Analysis ==> Hydrogen Bonds 以下を参考に詳細を設定する。 Selection 1 : protein Selection 2 : resname G39 Update selections every frame? : チ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Foosakik.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F11%2F18%2F132322" title="VMDで水素結合を解析する (GUI, CUI) - ウミガメバイオインフォ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/o/oosakik/20191115/20191115140219.png Hatena Blog https://hatena.blog 2019-11-18 13:23:22 rich https://oosakik.hatenablog.com/entry/2019/11/18/132322 1.0 100%