rnakato https://blog.hatena.ne.jp/rnakato/ Palmsonntagmorgen https://rnakato.hatenablog.jp/ ChIP-seq Linux NGS 公開されているゲノム配列は現在も更新中であるため、いくつかのバージョン (build) があります。 humanだとhg18, hg19, hg38などがあり、hg38が現時点で最新です。 NGS解析をするうえでは全ての解析データのbuildを統一する必要がありますが、「既存論文のデータの一部を用いたい」というような場合、buildが合わずに困ることがあります。 「自分はhg38で統一しているのに、既存論文のBEDファイルはhg19しか提供されてない」というような場合ですね。 そういった場合には LiftOver というツールを使うと、バージョンに合わせてBEDファイルを再生成してくれます。 … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Frnakato.hatenablog.jp%2Fentry%2F2018%2F07%2F12%2F114702" title="LiftOver: BEDファイルを異なるbuildへ変換 - Palmsonntagmorgen" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-07-12 11:47:02 rich https://rnakato.hatenablog.jp/entry/2018/07/12/114702 1.0 100%