rnakato https://blog.hatena.ne.jp/rnakato/ Palmsonntagmorgen https://rnakato.hatenablog.jp/ RNA-seq Genome NGS RNA-seq解析の記事を書こうとしたらgtfファイルの部分が長くなり過ぎたので単独記事にしました。 Gene annotation 既知遺伝子の情報を記載するファイルにはいくつかの形式があり、gtf形式はそのひとつです。 よく似たgff形式というものもありますが、微妙に異なります。 gtf形式の詳細については以下の記事を参考にしてください（丸投げ）。 GTFファイル | 遺伝子アノテーションファイルの処理 GTFファイルのダウンロード 遺伝子情報はダウンロード元のデータベースによってIDや情報の詳細度がかなり違います。 ここでは私がよく使うUCSC genome browserとEnsemb… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Frnakato.hatenablog.jp%2Fentry%2F2018%2F12%2F14%2F160618" title="Gene annotation データを用意する（gtf形式） - Palmsonntagmorgen" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-12-14 16:06:18 rich https://rnakato.hatenablog.jp/entry/2018/12/14/160618 1.0 100%