rnakato https://blog.hatena.ne.jp/rnakato/ Palmsonntagmorgen https://rnakato.hatenablog.jp/ Genome NGS RNA-seq 前回の記事↓の続きです。 STAR-RSEMによる発現量推定 その１ - Palmsonntagmorgen Stranded/Unstranded RNA-seq RNA-seqにはunstrandedとstranded の二種類があります。unstrandedの場合はmRNAに対して半々の確率で順鎖と逆鎖が読まれ、stranded の場合は逆鎖のみが読まれます(Illumina TruSeq kitの場合)。 最近のRNA-seqはほぼ全てStranded RNA-seqになっていると思いますが、古いデータはunstrandedである場合があります。 それぞれマッピング時のパラメータが異な… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Frnakato.hatenablog.jp%2Fentry%2F2018%2F12%2F28%2F184301" title="STAR-RSEMによる発現量推定 その2 (2020/08/20 追記) - Palmsonntagmorgen" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2018-12-28 18:43:01 rich https://rnakato.hatenablog.jp/entry/2018/12/28/184301 1.0 100%