rnakato https://blog.hatena.ne.jp/rnakato/ Palmsonntagmorgen https://rnakato.hatenablog.jp/ ChIP-seq NGS Linux 以下の記事の中で、sortコマンドについて触れていました。 rnakato.hatenablog.jp 多くのコマンドはsorted BEDを要求しますので、事前に以下のコマンドで全てのBEDをソートしておくとストレスがないかと思います。 $ sort -k1,1 -k2,2n in.bed > in.sorted.bed 今日はこのコマンドが何をしているのかについて解説します。 sortについて sortコマンドの使い方については以下のサイトがとてもわかりやすいです。 sortコマンドについて詳しくまとめました 【Linuxコマンド集】 ここではMACS2のピークファイルを使ってソートを実際… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Frnakato.hatenablog.jp%2Fentry%2F2021%2F01%2F20%2F155456" title="sortコマンドの使い方（ファイルのソート） - Palmsonntagmorgen" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-01-20 15:54:56 rich https://rnakato.hatenablog.jp/entry/2021/01/20/155456 1.0 100%