rnakato https://blog.hatena.ne.jp/rnakato/ Palmsonntagmorgen https://rnakato.hatenablog.jp/ NGS 雑文 解析環境構築 5年前にこんな記事を書きました。 この時はPython2系と3系の共存（というか、Anaconda環境構築のベストプラクティス）に苦労していました。 rnakato.hatenablog.jp 今はほとんどPython3系のみで事足りますが、依然としてdependenciesの問題は解決されていません。 特に、bioconda から多数のツールをインストールしようとするとconflictが多発します。conda-forge と比べて、登録されたツールのdependencyがきちんと管理されていないような印象です。 また、Pythonの公式ライブラリも後方互換をあまり重視していない感じであり、P… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Frnakato.hatenablog.jp%2Fentry%2F2022%2F08%2F15%2F215831" title="NGS解析のための共有サーバ環境構築を考える（2022年度版）（2022/9/12追記） - Palmsonntagmorgen" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2022-08-15 21:58:31 rich https://rnakato.hatenablog.jp/entry/2022/08/15/215831 1.0 100%