ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ 集団遺伝学 実習 Arlequin Arlequinの連鎖不平衡解析は遅いので原則、用いない。しかしながら、出力が丁寧なので、原理の学習という意味で連鎖不平衡のみなぞる。 EMアルゴリズムにてハプロタイプ頻度を推定し、それに基づいて連鎖不平衡の検定、および連鎖不平衡係数を計算している 連鎖不平衡に関する記載は、同じくSNPの連鎖不平衡を解析するアプリケーションであるHaploviewの出力との対比も含めて、こちらから Hardy-Weinberg平衡とその検定 HHW平衡に関する解説はこちら 個々のSNPにおけるHWE検定のほか、Phase既知の場合には、ハプロタイプ単位での検定も行う。仔細に出力を確認していないが、ヘテロ個体の… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20051216%2F1134720147" title="第５限　連鎖不平衡判定と連鎖不平衡係数の計算 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2005-12-16 17:02:27 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20051216/1134720147 1.0 100%