ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ 遺伝統計学 実習 Haploview ２マーカー間の連鎖不平衡関係を評価するとは、２マーカーが作るハプロタイプ(SNP２個の場合は４ハプロタイプ)の頻度の分布をもとに、「連鎖不平衡の程度」を「量」で表す方法と、「連鎖不平衡」の存在を「質(検定)」で表す方法とに分かれる いずれも、ハプロタイプ頻度が必要である。２マーカーのハプロタイプフェージングは簡単であるので、もっとも安定しているEMアルゴリズムによるハプロタイプ推定頻度を用いるのが通常である。 Haploviewでは、LDplotタブで２次元LDプロットを表示させた上で、メニューバーのFileから、Export current tab to textを選ぶと次のようなテキストフ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20051228%2F1135754418" title="第３限　SNP-SNPペア間の連鎖不平衡の評価 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://d.hatena.ne.jp/cgi-bin/mimetex.cgi?r%5E2 Hatena Blog https://hatena.blog 2005-12-28 16:20:18 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20051228/1135754418 1.0 100%