ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ Java 集団遺伝学 Glossary 前項のnucleotide polymorphismではDNA配列集団に存在する多型の分布を見たが、nucleotide diversityでは、集団を構成するDNA分子同士の異同箇所を問題にする。 全ペアにつき、異なる塩基箇所を数え、その和を、全ペア数ｘDNA配列長にて除す。その分散も、ソースに示した計算式で与えられる。 前項の例の場合は pi : 0.016 V(pi) : 0.000107 下のソースの出力例は File name seq2.txt No.seq 5 No.polysites 16 Length 500 S 全長における多型箇所の比率 0.032 theta : the … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20060901%2F1157081865" title="Nucleotide diversity - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2006-09-01 12:37:45 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20060901/1157081865 1.0 100%