ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ パーミュテーションテスト パーミュテーションテストに用いるcombining functionsについてはこちらの記事に記載した。 連鎖不平衡マッピングのデータに次の３関数を適用したとき、それぞれの試行で得られる、combining fucntion値の相関をコプロットしてみた。FisherとLiptakLogitとは、かなりよい。Tippetteはかなり悪い。Tippetteは試行において生じる最強関連多型のP値が、combining functionの値を決定するのに対して、他２関数の方は、多数の多型の偏り具合を加算しているから。 狭い領域に関連のオリジンがあり、関連を示す多型はすべてそれとLD関係にある場合などは… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20060927%2F1159318071" title="Combining functions同士の相関 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2006-09-27 09:47:51 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20060927/1159318071 1.0 100%