ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ 集団構造化 先日、Eigenanalysisについての記事(こちら)を書いた。 公開アプリケーションのケース・コントロール解析における、おおまかな実行手順は次の通り １ ジェノタイプ・フェノタイプ・マーカーに関するファイルを用意する ２ 本ツール用のフォーマットに直す ３ 実行する ４ サンプルの主成分分析がなされる ４−１ そのEigenvector,Eigenvalueが得られ、それに対するTracy-Widom P値が与えられる ４−２ 各個人がEigenvectorの線形和で表される(用いるEigenvectorの数は引数(-l)で与える ４−３ ケース・コントロールの２群が推定された集団構造にお… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20070323%2F1174623884" title="Eigenanalysis - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2007-03-23 13:24:44 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20070323/1174623884 1.0 100%