ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ CNV HWE 正確検定 アレルタイプ数をとする。Diploidではジェノタイプは。アレルをとし、その頻度を、観測本数をすると、ジェノタイプの観測人数がと表せる。 今、HWEにおける期待人数は,(ただしを観測人数、)と表される。 カイ自乗検定をするとすれば、、として表せる。 これを自由度で評価すれば、漸近検定になる。 他方、正確検定はどうなるか。 人、本の染色体。ホモの個体数はヘテロの個体数は。 観測ジェノタイプテーブルの生起確率は 書き換えて これを、すべてのテーブルについて算出し、大小比較して累積することで正確確率が出る。・・・問題は、可能なテーブルすべてを網羅するための計算量ではあるが。昨日のソースにHWE検定を… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20071113%2F1194519571" title="CNV多型をはじめとする多(３以上)アレルのHWE検定 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2007-11-13 19:59:31 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20071113/1194519571 1.0 100%