ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ R IsoGene affy こちらの続き：用量反応を見るとする こちらにIsoGeneというRのパッケージの論文がある マイクロアレイのデータで、薬を振りかけて、用量依存に発現量が動くかどうかを大規模・マルチプルテスティングの枠組みで調べよう、いくつかの統計量があるから、ひとまずいろいろ出すだけ出してみよう、とこういうパッケージである affyパッケージに依存しており、こちらはbioconductorからとる ここで行っている回帰はpool-adjacent-violators algorithm(pava)。それについてはこちらの記事へ install.packages("IsoGene") # パッケージのダウンロー… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20111029%2F1319769534" title="用量反応を大規模に - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/r/ryamada22/20111028/20111028113235.png Hatena Blog https://hatena.blog 2011-10-29 11:38:54 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20111029/1319769534 1.0 100%