ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ 次世代シークエンサー de novo Kolmogorov-Smirnov Grantham matrix Grantham dissimilarity matrix phyloP こちら("Exome sequencing supports a de novo mutational paradigm for schizophrenia")の論文では、表現型に「機能性の予想される」「de novo 変異」をエクソーム・シークエンスで探している de novo と思われる変異をシークエンシングで見つけて その変異にスコアを与えて(スコア化の色々について) スコアの分布が２群間で異なるかどうかを検定している その検定の構造 まずは、「値」与える 進化の歴史に照らす phyloP Rでは以下のパッケージの関数phyloP()がそうか？ library(rphast) help(… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20120423%2F1335154874" title="de novo 変異の検定 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2012-04-23 13:21:14 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20120423/1335154874 1.0 100%