ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ 駆け足で読むシリーズ ENCODE サイト(01) 転写因子結合部位モチーフ(配列のパターン) 実験設定 DNA-binding proteins 119個 72 cell typesとそれらが持つ多数のRNA polymerase構成因子 ChIP-seq 結果概要 87/119個のDNA-binding proteingsが配列特異的転写因子(TFSS:Transcription Factor Sequence-Specific) 636,336調節配列が231Mbに渡って存在 Binding sitesはDNA-bindingモチーフを持っているものが大多数で、そのうちの多くは既知のモチーフだったが新規モチーフも認めた 個… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20130810%2F1376095599" title="01 Transcription factor motifs :駆け足でサーフする『ENCODE explorer (nature)』 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/bf/KozakConsensus.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2013-08-10 09:46:39 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20130810/1376095599 1.0 100%