ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ ぱらぱらめくるシリーズ Deep Sequencing 次世代シークエンサー マッピングの基礎知識 マッピングでは読まれたリードの配列がreference配列のある部分の合致する部分を探して、その位置を決める 長ければ長いほど配列の特異性は高く、特異的にマッピングされる(ゲノム上に１箇所だけが合致箇所と想定される)、短ければその逆。また、読まれたリードの全塩基が揃って合致しないといけないかと言えば、配列多様性があればもちろん、そうはならない。 この辺りの、「合致の特異度の強さ」「塩基違い・塩基のin/delの許容度」などはマッピングツールによって異なり、また、１つのマッピングツールでもその評価点のつけ方・閾値の取り方を変えられる。 従って、同一の実験結果でも、結果は色々… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20140118%2F1389930975" title="3. Short Read Mapping の正確さ：ぱらぱらめくる『Deep Sequencing Data Analysis』 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/r/ryamada22/20140118/20140118054321.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2014-01-18 12:56:15 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20140118/1389930975 1.0 100%