ryamada22 https://blog.hatena.ne.jp/ryamada22/ ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ https://ryamada22.hatenablog.jp/ 遺伝率 heritability SNP GWAS missing heritability 0,1,2のジェノタイプデータは平均はアレル頻度に依存するし、分散もアレル頻度に依存する 今、遺伝率を計算するときには、全座位のもたらす「分散」の和が欲しいので、すべての座位を分散的に同じように扱えるとよい そうすると、線形回帰してやったとき、遺伝要因の分散は、線形回帰係数の二乗の和になるから Rでやってみる # 平均0,分散1に変換する関数 my.standardize <- function(x){ m <- mean(x) v <- 1/length(x) * sum((x-m)^2) ret <- (x-m)/sqrt(v) ret } # No. loci n.marker <- 1… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fryamada22.hatenablog.jp%2Fentry%2F20160316%2F1458178190" title="標準化ジェノタイプ - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2016-03-16 10:29:50 rich https://ryamada22.hatenablog.jp/entry/20160316/1458178190 1.0 100%