skume https://blog.hatena.ne.jp/skume/ 京橋のバイオインフォマティシャンの日常 https://skume.net/ R - ビッグデータ解析の処方箋 R - igraph R - ネットワーク図作成 R - 大規模ネットワーク par - family日本語設定 R - 軸表示無し はじめに graphics::plot.defaultによるネットワーク図の作成例 グラフ・ノード数による描画時間の比較 実行時間の可視化 まとめ 参考資料 はじめに Rでのネットワーク図の作成では、igraph packageがよく使われる。 ただ、igraphによるネットワーク図の描写は、１万ノードを超えたあたりから、結構な時間がかかる。 そのため、１０万ノードを超えるような、大規模なネットワーク図の描画には、ちょっとしたコツがある。 今回、そんな大規模なネットワークの作成方法を取り上げ、実際の実行時間を検証してみた。 結論的には、igraph::plot.igraphを使うよりも、gra… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fskume.net%2Fentry%2F2021%2F03%2F21%2F183823" title="【R・ビッグデータ解析の処方箋】Rで、１０万ノードを超える大きなネットワーク図を描画するTips 〜 igraph::plot.igraphは使い物にならない件 〜 - 京橋のバイオインフォマティシャンの日常" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/s/skume/20220115/20220115222547.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-03-21 18:38:23 rich https://skume.net/entry/2021/03/21/183823 1.0 100%