skume https://blog.hatena.ne.jp/skume/ 京橋のバイオインフォマティシャンの日常 https://skume.net/ M1 Mac Mac flash2 ペアエンドリード FASTQ形式 FASTQファイル シーケンスデータ シークエンスデータの取得 NGSデータ Terminalコマンド - wget Terminalコマンド - echo Terminalコマンド - gzip zsh - バイオインフォ zsh - make Mac - 環境構築 NGS - リードマージ Terminalコマンド Bioinfoツール設定 Bioinformatics はじめに FLASHの原著論文 今回のzsh実行環境 M1 Macにおけるflash2のインストール flash2によるペアエンドfastqのマージ実行 GAGEからペアエンドのfastqデータを取得する まとめ ゲノム解析の関連記事 参考資料 補足 FASTQ形式からFASTA形式への変換 - sedコマンドを使う方法 FASTQ形式からFASTA形式への変換 - fastq_to_fastaを使う方法 Anacondaの設定 FLASH-1.2.11のインストール方法 from sourceforge.net flash -h の出力 flash2 --h の出力 はじめに この記事では、… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fskume.net%2Fentry%2F2022%2F07%2F13%2F001424" title="M1 Mac環境で、flash2を使ってペアエンドfastqをマージしてみた件 - 京橋のバイオインフォマティシャンの日常" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/s/skume/20220712/20220712235525.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-07-13 00:14:24 rich https://skume.net/entry/2022/07/13/001424 1.0 100%