skume https://blog.hatena.ne.jp/skume/ 京橋のバイオインフォマティシャンの日常 https://skume.net/ R DNA配列 FASTA形式 R - seqinr R - seqinr::read.fasta R - seqinr::s2c R - seqinr::c2s R - seqinr::comp R - Biostrings R - BiocManager R - Biostrings::readDNAStringSet R - Biostrings::complement R x 核酸配列データ はじめに seqinrパッケージのインストール Biostringsパッケージのインストール seqinr::read.fastaを使って、HIV-1 全ゲノムのFASTAファイルの読み込み場合 seqinr::read.fastaを使って、FASTAを「ベクトル」として読み込む seqinr::read.fastaを使って、FASTAを「文字列」として読み込む 読み込んだ配列データから相補配列を求める配列データ処理の基本 Biostrings::readDNAStringSetを使って、HIV-1 全ゲノムのFASTAファイルの読み込み場合 HIV-1 (ヒト免疫不全ウイルス-1) の全ゲノ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fskume.net%2Fentry%2F2022%2F10%2F14%2F050000" title="R言語で核酸配列データを扱ってみた件【その2: FASTAフォーマット・ファイルの読み込み】 - 京橋のバイオインフォマティシャンの日常" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/s/skume/20220115/20220115214037.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-10-14 05:00:00 rich https://skume.net/entry/2022/10/14/050000 1.0 100%