amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス tokunagaです。 今回は、遺伝子発現変動を網羅的に調べたいときに使われているmicroarrayのデータ解析について流れを簡単にご紹介します。 生データ 発光強度をスキャナーの画像から数値化する ↓ バックグラウンド補正 出力された時点で補正されている場合もある ↓ 正規化 サンプル別のバラつきを揃える ↓ フィルタリングによる絞込み 群間の有意差、p-value、FC、シグナル強度etc.の情報を基に絞り込む ↓ クラスタリング、ヒートマップ作成 ↓ アノーテーション付け 遺伝子、GO etc.の情報を付与する 後半は目的によって変化してくると思います。 今はRのパッケージが色々とそろ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F05%2F07%2F182147" title="Microarray解析 - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2012-05-07 18:21:47 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/05/07/182147 1.0 100%