amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス 今日から次世代シーケンサー解析で使われているformatについて書いていきたいと思います。 まず、今回はfastq formatについてです。 ・構成 塩基配列と各塩基に対するquality valueの情報が書かれているテキストファイルです。各リードは4行で構成されています。 [例]① @SRR022885.1 BI:080102_SL-XAR_0001_ FC201E9AAXX:6:1:752:593 ② CGTACCAATTATTCAACGTCGCCAGTTGCTTCATGT ③ +④ IIIIIIIIII>IIIIIII@IIII.I+I>35I0I&+/ 次回に続きます。 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F05%2F17%2F144955" title="fastq format① - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/fig.4.png Hatena Blog https://hatena.blog 2012-05-17 14:49:55 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/05/17/144955 1.0 100%