amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 どうもakbです。 今日からVCF formatの連載が始まります。 さて、VCFとは (Variant Call Format)の略で、次世代シーケンサー解析に用いられるformatの一つです。 samtoolsを用いて抽出した多型情報が、VCFファイルに格納されて出力されます。 まず、VCFファイルの中身を見てみます。 ファイルのメタデータは、"##"の文字列の後に記載されています。 例えば、最初の行には、VCFのバージョンが次のように示されます。 （例） ##fileformat = VCFv4.1 次にVCFファイルの本体で使用されるフィルタ（INFO）とFORMATが、 メタデータセ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F05%2F23%2F091656" title="VCF format① - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/vcf2.png.400px.png Hatena Blog https://hatena.blog 2012-05-23 09:16:56 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/05/23/091656 1.0 100%