amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 どうもakbです。 VCF formatの連載三日目です。 今日は、FORMATの"PL"について説明しようと思います。 まず、前回の復習ですが、FORMATの"GT"はGenotypeの略で 0:reference 1:alternate(sample1)のように数字に意味を持たせており、 0/0,0/1,1/1はそれぞれREFのホモ、REFとALTのヘテロ、ALTのホモを示します。 まず図をご覧ください。 （例） -------------------------------------------- REF = A ALT = G GT:PL 0/1:191,0,255 --------… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F05%2F25%2F124938" title="VCF format③ - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/ccccc.png.400px.png Hatena Blog https://hatena.blog 2012-05-25 12:49:38 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/05/25/124938 1.0 100%