amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 tokunagaです。 少し1回目と間が空いてしまいましたが、 本日はfastq formatの2回目です。 各リードの4行目に記されているqualityについて説明したいと思います。 ・Quality value 3行目に使われているquality valueは以下のように計算されています。 ・ASCIIコード 各塩基ごとのquality valueを一文字で表すためにASCIIコードが使われています。 ・比較 S - Sanger Phred+33, raw reads typically (0, 40) X - Solexa Solexa+64, raw reads typically … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F05%2F28%2F093201" title="fastq format② - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/fig.15.png Hatena Blog https://hatena.blog 2012-05-28 09:32:01 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/05/28/093201 1.0 100%