amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 こんにちは。detです。 今日は前回のQCの道 その３の続きです。 FASTX-Toolkitが持つ機能について、引き続き紹介いたします。 ・fastq_quality_trimmer FASTQ ファイルの各リードの 3'側から、指定したクオリティ値(qv)未満の塩基を順番に削除していきます。指定したqvより高いqvの塩基が見つかったら、そこでストップします。そして削除の結果、リードの長さが指定した長さ未満になった時はそのリード自体が削除されます。5'側からの削除には対応していません。 【optionの説明】 -h: ヘルプを表示します。 -t N: qvの閾値を指定します。この閾値未満の塩… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F06%2F26%2F164927" title="QCの道　その４ - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2012-06-26 16:49:27 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/06/26/164927 1.0 100%