amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス こんにちは。detです。 今日は前回のQCの道 その５の続きです。 FASTX-Toolkitの使い方について、引き続き紹介いたします。 ・fastx_quality_stats FASTA/Q ファイルのリードに含まれる塩基のポジション毎の統計量を算出し、表形式で出力してくれます。FASTA形式の入力を与えたときは、クオリティに関する項目は出力されません。 【出力される各項目の説明】 column: 5'末端から数えた塩基の位置 count: そのポジションの塩基数 min: そのポジションで最も低いqv max: そのポジションで最も高いqv sum: そのポジションのqvを全て足した値 … 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F07%2F10%2F172954" title="QCの道　その６ - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/hoge.png.400px.jpg Hatena Blog https://hatena.blog 2012-07-10 17:29:54 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/07/10/172954 1.0 100%