amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 hatです。前回から随分開いてしまいましたが、BWA v0.5.xとv0.6.xの比較(1)のつづきです。 bwa v0.5.x系とv0.6.x系のマッピング結果の違いを、公開データを使って比較してみました。 それぞれhg19に対してマッピングして、samtools flagstatでマッピング結果を出しました。 ■使用したデータ ERR034601（日本人女性Exome） ■bwa v0.5.9のマッピング結果 118495810 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) 0 + 0 duplicates 117074076 + 0 m… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F07%2F26%2F143307" title="BWA v0.5.xとv0.6.xの比較(2) - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/diff_bwa059_060_2.png.300px.png Hatena Blog https://hatena.blog 2012-07-26 14:33:07 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/07/26/143307 1.0 100%