amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス こんにちは。detです。 今日はQCの道 その６の続きです。 FASTX-Toolkitの使い方について、引き続き紹介いたします。 ・fastx_collapser FASTA/Q ファイルの中で、同じ配列のリードが重複して存在していた場合に１つを除いてすべて削除します。入力がFASTQ形式の場合は強制的にFASTA形式で出力され、ID行は連番で振り直されます。重複していたリードのID行には[連番-重複数]の形式で重複数が記載されます。 【optionの説明】 -h: ヘルプを表示します。 -i: 入力ファイルを指定します。 -o: 出力ファイルを指定します。指定しない場合は標準出力に出力され… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2012%2F08%2F03%2F173422" title="QCの道　その７ - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2012-08-03 17:34:22 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2012/08/03/173422 1.0 100%