amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス マッピングソフトウェアの性能比較をする際に、 正解がわかっているデータを使いたい場合があります。 そんな時に便利な、ゲノム配列からFastqファイルを作成できる ArtificialFastqGeneratorというソフトウェアをご紹介します。 例えばヒトゲノムhg19から150bp Paired-EndのFastqを作成するには 以下のようなコマンドを実行します。 $ java -jar ArtificialFastqGenerator.jar -R hg19.fa -O OUTNAME -RCNF 2 -S ">chr1" -E ">" -RL 150 パラメータの意味です。 ・-R：ゲノ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2013%2F06%2F28%2F141402" title="テスト用Fastqファイルを作る - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2013-06-28 14:14:02 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2013/06/28/141402 1.0 100%