amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 前回は、次世代シーケンスデータを用いて構造多型を検出するツールのうち、split-read mappingを用いているものを紹介しました。 今回の記事ではpair-end mappingを用いているツールをご紹介します。 MoDIL 10-50 bpのindelの検出ツールです。 ライブラリのInsert sizeの分布とマップされたreadのinsert sizeを比較し、その変化からindelを検出します。そのため、検出されたindelサイズは直接観測したものではなく間接的に推測した値になりますが、論文では実際の値と非常に近い値となったようです。 十分なdepthのあるshort read… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2013%2F11%2F20%2F151732" title="構造多型を解析するツール : pair-end mapping - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2013-11-20 15:17:32 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2013/11/20/151732 1.0 100%