amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス Circosを使ってみようでご紹介したCircosを使って、 以下のようなヒトのChainSelfの図を描いてみたいと思います。 手順 （１）データファイル用意 （２）設定ファイル作成 （３）Circos実行 今回は「（１）データファイル用意」を行います。 ChainSelfは、ヒトゲノムを自分自身にアライメントして、 類似領域を探したデータです。 データはUCSCから入手可能です。 UCSC hgdownloadから、chainSelf.txt.gzをダウンロードして 解凍します。 ChainSelfのように、ゲノム上の2領域間をつなぐデータは CircosではLinkトラックという形式で表… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2013%2F12%2F26%2F150932" title="CircosでSelfChainを描く（１） - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/circos_selfChain_small.png Hatena Blog https://hatena.blog 2013-12-26 15:09:32 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2013/12/26/150932 1.0 100%