amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 次世代シーケンサ解析 ある公開されているexomeデータのfastqファイルをダウンロードして解析しようとしたところ、うまくいきませんでした。 最初は何が何だかわからず困っていたのですが、fastqファイルを確認するとID行の書式がよく見かけるものと違いました。 例として、最初の1リードはこうなっていました。@HWI-ST7001130:252:C258HACXX:5:1101:1723:2158¥R1 ACCTGTTGCTTCCCCTGGGACTGAAGGCAGAAGTGACTCCCGAAATTCTCTTTCTGGACTCAGAAGGAAACCAAAGCAATCGATGACACCGCATCNNNNAC + ?7?… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2015%2F04%2F23%2F143749" title="fastqのIDの書式の話 - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2015-04-23 14:37:49 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2015/04/23/143749 1.0 100%