amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ 統計解析ソフトR Bioconductorのseq2pathwayパッケージを使ってパスウェイのアノテーションを行います。 ※seq2pathwayのインストールはこちらの記事をご覧ください。 seq2pathwayパッケージに含まれているテストデータを使ってテストしてみましょう。 library(seq2pathway) data(dat_chip) こんなデータです。遺伝子名とスコアのセットです。 head(dat_chip) これらの遺伝子に対して、パスウェイをアノテートします。 遺伝子情報は、seq2pathwayに入っているMsigDB_C5データを使います。 data(MsigDB_C5,packa… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2015%2F08%2F21%2F151421" title="seq2pathwayでアノテーション（後） - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> http://blog.image.s3.amazonaws.com/seq2pathway_3.PNG Hatena Blog https://hatena.blog 2015-08-21 15:14:21 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2015/08/21/151421 1.0 100%