amelieff https://blog.hatena.ne.jp/amelieff/ バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ https://staffblog.amelieff.jp/ バイオインフォマティクス TopHat-Fusionは、マッピングソフトのTopHatから派生した機能で、融合遺伝子を検出するのに広く使われています。 TopHat-Fusionを実行すると、fusions.outという候補となるポジションやリード数などの情報が出力されます。fusion.outの説明は、NGS Surfer's Wikiに書かれていますので、詳しくはこちらをご覧ください。 出力されたファイルに対してtophat-fusion-postというコマンドを実行すると、フィルタリングされた結果（result.txt）が作られます。 このresult.txtの見方を、BCAS4-BCAS3の検出を例に説明したい… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fstaffblog.amelieff.jp%2Fentry%2F2015%2F10%2F22%2F142005" title="TopHat-Fusionの結果の見方 - バイオインフォマティクス実践ラボ｜アメリエフ技術ブログ" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2015-10-22 14:20:05 rich https://staffblog.amelieff.jp/entry/2015/10/22/142005 1.0 100%