twad https://blog.hatena.ne.jp/twad/ twadの日記 https://twad.hatenadiary.org/ ようやく見つけた突破口。makeblastdbとblastnは、もともと自分のホームディレクトリの中にあり、通常のspraiだとこれを使ってコンティグを作成する（はず）。正確には、~/lcl/bin/の中にあり、それぞれちゃんと存在を確認できた。 qsubでジョブを投げた時は、これをちゃんと見に行くことができないのだろう。ec.specの中で設定した変数blast_pathはezez_v7.plの中では利用されておらず、このあたりをうまく修正することが鍵になるに違いない。ec.specの中で設定したパスは２つ。 sprai_path=~/lcl/bin/ blast_path=~/lcl/bi… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Ftwad.hatenadiary.org%2Fentry%2F20131224%2F1387898174" title="ezez_v7.pl 2 - twadの日記" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2013-12-24 00:16:14 rich https://twad.hatenadiary.org/entry/20131224/1387898174 1.0 100%