warbler https://blog.hatena.ne.jp/warbler/ warbler’s diary https://warbler.hatenablog.com/ EM関係 前回、EM菌（EM1活性液）に含まれる細菌の構成を、メタ16S解析（V3V4領域）をした結果を報告しました。 この解析には一般的に行われている手法を用いましたが、その改良版が出されましたので、それを用いて再解析をしてみました。 【QIIMEとQIIME2の違い】 解析パイプライン「QIIME」を改良した「QIIME2」の特徴として、NGS解析で得られたDNA配列データを分類する際のエラーを減らす「DADA2」という手法が取り入れられています。 ・半田佳宏氏による解説 http://crusade1096.web.fc2.com/qiime2_renew.html （参考文献） www.ncbi… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fwarbler.hatenablog.com%2Fentry%2F2019%2F01%2F20%2F155405" title="EM菌に含まれる微生物の解析ー細菌類ーその２ - warbler’s diary" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/w/warbler/20190120/20190120145506.png Hatena Blog https://hatena.blog 2019-01-20 15:54:05 rich https://warbler.hatenablog.com/entry/2019/01/20/155405 1.0 100%