WEBIFRY https://blog.hatena.ne.jp/WEBIFRY/ Fry in the Web https://webifry.hateblo.jp/ 遺伝研スパコンにログインする方法や、sshの使い方については解説しません。 多少RNAseq解析に対して知識があり、RNAseqをもっと高速にできないか、または自分でできないか？と考えている方向けに解説します。 使うもの Nextflow 遺伝研スパコン Nextflowとは ワークフローツールです。発現解析ではsamtoolsや、fastQC,salmon....など大量のツールをインストールする必要があります。また、時間がかかる処理の出力を何度も次のツールに入れなくてはならない上に、サンプルデータが10種類を超えることも珍しくありません。また、ツールの依存関係やバージョン管理も非常に煩雑で… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fwebifry.hateblo.jp%2Fentry%2F2021%2F11%2F17%2F142759" title="遺伝研スパコンでRNAseqを最速・自動で行う - Fry in the Web" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-11-17 14:27:59 rich https://webifry.hateblo.jp/entry/2021/11/17/142759 1.0 100%