yaboojp https://blog.hatena.ne.jp/yaboojp/ けみげの https://yaboojp.hatenadiary.org/ CDK ふたつの化学構造が同一構造なのか、手っ取り早く知りたいとき、 "Canonical (正準化された)" SMILES形式を使うと便利です。 化学構造を"通常の"SMILES形式で表現しようとすると、一意に定まらないことがあります。 たとえば、エーテル（diethyl ether）の場合、 CCOCC C(C)OCC C(OCC)C O(CC)CC のように、記述の開始点と順序により、４通りの表現が可能です。 そこで、これらの中からひとつ代表SMILESに統一しよう、そうすれば 文字列の一致が化学構造の一致に対応付けられる、というのが"Canonical"の考え方です。 さて、ここからは実装の話… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fyaboojp.hatenadiary.org%2Fentry%2F20110827%2F1314403506" title="Canonical SMILES - けみげの" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2011-08-27 09:05:06 rich https://yaboojp.hatenadiary.org/entry/20110827/1314403506 1.0 100%